Ну, а сколько времени нужно, чтобы создать тысячу папок, скажем, за месяц? Я бы поспорил не много. Это заняло бы много времени, если бы вы регулярно удаляли и создавали папки, но мне кажется, что единственными файлами, которые будут регулярно изменяться, будут сами файлы изображений (или, в худшем случае, сами папки изначально, поскольку они не будут существовать сначала, но со временем это уменьшится), что равносильно тому, как если бы вы с самого начала собрали все в одну папку.
Очевидно, следите за пространством и состоянием дефрагментации вашего диска, но с небольшим обслуживанием я не ожидаю больших трудностей в вашей идее.
Рекомендую посмотреть эти видео для лучшего погружения в вопрос: